Item


Ecophysiology and philogeny of Faecalibacterium prausnitzii in healthy and diseased gut. Application in Inflamatory Bowel Disease diagnostics

In this PhD thesis Faecalibacterium prausnitzii populations of patients with gut disease and healthy individuals have been characterized. First, isolates from healthy volunteers have been phenotypically characterised, which has allowed to gain insight into the physiology of this species. A possible link between F. prausnitzii sensitivity to changes in gut physicochemical conditions and its disappearance in a diseased gut has been revealed. Second, molecular studies on F. prausnitzii populations have allowed to define two phylogroups within this species, and to describe the diversity of phylotypes in healthy individuals and in patients with intestinal disease. The phylotypes specifically compromised in patients suffering some gut disorders have been identified. Finally, new molecular tools for the detection and quantification of this species and its phylogroups have been designed. Their usefulness to be implemented as complementary molecular tools for the diagnosis and prognosis of intestinal diseases has been determined.

En aquesta tesi doctoral s鈥檋a estudiat la poblaci贸 de Faecalibacterium prausnitzii de pacients amb malalties intestinals i individus sans. En primer lloc, es va realitzar una caracteritzaci贸 fenot铆pica d鈥檃铆llats d鈥檃queta esp猫cie obtinguts d鈥檌ndividus sans, el que ha perm猫s adquirir coneixement sobre la fisiologia d鈥檃questa esp猫cie. S鈥檋a evidenciat una possible relaci贸 entre la sensibilitat de F.prausnitzii a canvis en les condicions fisicoqu铆miques de l鈥檌ntest铆 i la seva desaparici贸 en un intest铆 malalt. En segon lloc, s鈥檋an realitzat estudis moleculars de les poblacions de F. prausnitzii. Aix貌 ha perm猫s definir dos filogrups dins d鈥檃questa esp猫cie, i descriure la diversitat de filotips en individus sans i pacients amb malalties intestinals.Per primera vegada, s鈥檋an identificat els filotips especificament compromesos en pacients que pateixen determinades malalties intestinals. Per 煤ltim, s鈥檋an dissenyat eines moleculars per a la detecci贸 i quantificaci贸 d鈥檃questa esp猫cie i els seus filogrups. S鈥檋a determinat la utilitat d鈥檃questes eines moleculars per al suport al diagn貌stic o progn貌stic de malalties intestinals.

Universitat de Girona

Other contributions: Universitat de Girona. Departament de Biologia
Author: L贸pez Siles, Mireia
Date: 2016 January 25
Abstract: In this PhD thesis Faecalibacterium prausnitzii populations of patients with gut disease and healthy individuals have been characterized. First, isolates from healthy volunteers have been phenotypically characterised, which has allowed to gain insight into the physiology of this species. A possible link between F. prausnitzii sensitivity to changes in gut physicochemical conditions and its disappearance in a diseased gut has been revealed. Second, molecular studies on F. prausnitzii populations have allowed to define two phylogroups within this species, and to describe the diversity of phylotypes in healthy individuals and in patients with intestinal disease. The phylotypes specifically compromised in patients suffering some gut disorders have been identified. Finally, new molecular tools for the detection and quantification of this species and its phylogroups have been designed. Their usefulness to be implemented as complementary molecular tools for the diagnosis and prognosis of intestinal diseases has been determined.
En aquesta tesi doctoral s鈥檋a estudiat la poblaci贸 de Faecalibacterium prausnitzii de pacients amb malalties intestinals i individus sans. En primer lloc, es va realitzar una caracteritzaci贸 fenot铆pica d鈥檃铆llats d鈥檃queta esp猫cie obtinguts d鈥檌ndividus sans, el que ha perm猫s adquirir coneixement sobre la fisiologia d鈥檃questa esp猫cie. S鈥檋a evidenciat una possible relaci贸 entre la sensibilitat de F.prausnitzii a canvis en les condicions fisicoqu铆miques de l鈥檌ntest铆 i la seva desaparici贸 en un intest铆 malalt. En segon lloc, s鈥檋an realitzat estudis moleculars de les poblacions de F. prausnitzii. Aix貌 ha perm猫s definir dos filogrups dins d鈥檃questa esp猫cie, i descriure la diversitat de filotips en individus sans i pacients amb malalties intestinals.Per primera vegada, s鈥檋an identificat els filotips especificament compromesos en pacients que pateixen determinades malalties intestinals. Per 煤ltim, s鈥檋an dissenyat eines moleculars per a la detecci贸 i quantificaci贸 d鈥檃questa esp猫cie i els seus filogrups. S鈥檋a determinat la utilitat d鈥檃questes eines moleculars per al suport al diagn貌stic o progn貌stic de malalties intestinals.
Format: application/pdf
Other identifiers: http://hdl.handle.net/10803/369044
Document access: http://hdl.handle.net/10256/12291
Language: eng
Publisher: Universitat de Girona
Rights: ADVERTIMENT. L鈥檃cc茅s als continguts d鈥檃questa tesi doctoral i la seva utilitzaci贸 ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, aix铆 com en activitats o materials d鈥檌nvestigaci贸 i doc猫ncia en els termes establerts a l鈥檃rt. 32 del Text Ref贸s de la Llei de Propietat Intel路lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l鈥檃utoritzaci贸 pr猫via i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilitzaci贸 dels seus continguts caldr脿 indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el t铆tol de la tesi doctoral. No s鈥檃utoritza la seva reproducci贸 o altres formes d鈥檈xplotaci贸 efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicaci贸 p煤blica des d鈥檜n lloc ali猫 al servei TDX. Tampoc s鈥檃utoritza la presentaci贸 del seu contingut en una finestra o marc ali猫 a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i 铆ndexs.
Subject: Faecalibacterium prausnitzii
Crohn鈥檚 disease
Malaltia de Crohn
Enfermedad de Crohn
Ulcerative colitis
Colorectal cancer
Cancer colorectal
Gut diseases
Malalties intestinals
Enfermedades intestinales
Gut microbiology
Microbiologia intestinal
Inflamatory Bowel Disease
579 - Microbiologia
616.3 - Patologia de l鈥檃parell digestiu. Odontologia
Title: Ecophysiology and philogeny of Faecalibacterium prausnitzii in healthy and diseased gut. Application in Inflamatory Bowel Disease diagnostics
Type: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Repository: DUGiDocs

Subjects

Authors