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Microbial community assembly and biogeography in the Pyrenean lacustrine district

The microbial metacommunity of the Pyrenees mountain range has never been studied at the regional level. In this PhD thesis, the main goal is to describe the taxonomic diversity and reveal the ecological processes (biotic and abiotic) behind the spatial distribution and heterogeneity of surface communities of alpine lakes. With a sampling of more than 300 lakes during summer of 2011 and high-througput sequencing of ribosomal markers (16S and 18S rRNA), we analized the microbial profiles of archaeal, bacterial and eukaryotic communities. We highlighted the discovery and description of novel and unknown lineages such as Pacearchaeota or Woesearchaeota (Archaea) or Chytridiomycota (Eukarya). We analyzed the role of environmental filtering and dispersal processes, as well as potential species interactions as drivers of local community assemblages

La metacomunidad microbiana de Pirineos nunca ha sido estudiada a nivel de región completa. En esta tesis se busca describir la diversidad taxonómica y revelar los procesos ecológicos (bióticos y abióticos) que pueden estar tras la distribución espacial y la heterogeneidad de las comunidades superficiales de lagos alpinos. Mediante un muestreo de más de 300 lagos durante el verano de 2011 y técnicas de secuenciación masiva de genes ribosómicos (16S y 18S rRNA) se obtuvieron los perfiles microbianos de comunidades de arqueas, bacterias y eucariotas. Se puso énfasis en el descubrimiento y descripción de linajes nóveles y desconocidos como Pacearchaeota o Woesearchaeota (Archaea) o Chytridiomycota (Eukarya). Se analizan el filtro ambiental y procesos de dispersión, así como las interacciones potenciales entre especies como responsables del ensamblaje de las comunidades locales

Universitat de Girona

Manager: Ortega Casamayor, Emilio
Guasch i Padró, Helena
Other contributions: Universitat de Girona. Departament de Ciències Ambientals
Author: Ortiz Álvarez, Rüdiger
Date: 2018 May 18
Abstract: The microbial metacommunity of the Pyrenees mountain range has never been studied at the regional level. In this PhD thesis, the main goal is to describe the taxonomic diversity and reveal the ecological processes (biotic and abiotic) behind the spatial distribution and heterogeneity of surface communities of alpine lakes. With a sampling of more than 300 lakes during summer of 2011 and high-througput sequencing of ribosomal markers (16S and 18S rRNA), we analized the microbial profiles of archaeal, bacterial and eukaryotic communities. We highlighted the discovery and description of novel and unknown lineages such as Pacearchaeota or Woesearchaeota (Archaea) or Chytridiomycota (Eukarya). We analyzed the role of environmental filtering and dispersal processes, as well as potential species interactions as drivers of local community assemblages
La metacomunidad microbiana de Pirineos nunca ha sido estudiada a nivel de región completa. En esta tesis se busca describir la diversidad taxonómica y revelar los procesos ecológicos (bióticos y abióticos) que pueden estar tras la distribución espacial y la heterogeneidad de las comunidades superficiales de lagos alpinos. Mediante un muestreo de más de 300 lagos durante el verano de 2011 y técnicas de secuenciación masiva de genes ribosómicos (16S y 18S rRNA) se obtuvieron los perfiles microbianos de comunidades de arqueas, bacterias y eucariotas. Se puso énfasis en el descubrimiento y descripción de linajes nóveles y desconocidos como Pacearchaeota o Woesearchaeota (Archaea) o Chytridiomycota (Eukarya). Se analizan el filtro ambiental y procesos de dispersión, así como las interacciones potenciales entre especies como responsables del ensamblaje de las comunidades locales
Format: application/pdf
Other identifiers: http://hdl.handle.net/10803/663398
Document access: http://hdl.handle.net/10256/15893
Language: eng
Publisher: Universitat de Girona
Rights: L’accés als continguts d’aquesta tesi queda condicionat a l’acceptació de les condicions d’ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Subject: Microbiologia
Microbiología
Microbiology
Eubacteris
Bacterias
Bacteria
Ecologia
Ecología
Ecology
Limnologia
Limnología
Limnology
Arquees
Arqueas
Archaea
Eucariotes
Eucariotas
Eukarya
504 - Ciències del medi ambient
579 - Microbiologia
Title: Microbial community assembly and biogeography in the Pyrenean lacustrine district
Type: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Repository: DUGiDocs

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Authors