DUGi

Microbial communities responses in fluvial biofilms under metal stressed scenarios

http://dugi.udg.edu/item/http:@@@@hdl.handle.net@@10256@@19521

Romaní i Cornet, Anna M.

This thesis shows how the metals of natural and anthropic origin change significantly the composition of the prokaryotic communities (mainly the composition of bacteria). The β-diversity is the most sensitive variable to the effects of metals, unlike α-diversity, which is hardly affected or even benefited. In scenarios with high and chronic metal pollution, the resident community (DNA fraction) suffers changes in its composition that can be detected at phylum or class taxonomic level. However, in fluvial ecosystems, subjected to lower levels of metal pollution, only the RNA fraction is affected by selecting more active OTUs/ASVs. In addition, the knowledge about the bacterial composition of communities and, consequently, the selection of specific taxa is useful to find some potential prokaryotes functions important in stress response caused by metals

Esta tesis muestra cómo los metales de origen natural y antrópico cambian la composición de las comunidades de procariotas, sobre todo de las bacterias. La β-diversidad es la variable más sensible a los efectos de los metales, a diferencia de la α-diversidad, que no se muestra casi afectada o incluso es beneficiada. En escenarios con contaminación alta y crónica de metales, la comunidad residente (fracción de ADN) sufre cambios en su composición que pueden ser detectados a nivel de filo o clase. Sin embargo, en ecosistemas fluviales sometidos a niveles más bajos de contaminación de metales sólo la fracción de ARN se ve afectada selecionando los OTUs/ASVs más activos. El conocimiento de la composición de la comunidad bacteriana y por consiguiente la elección de algunos taxones como bioindicadores, ayuda a encontrar funciones potenciales de las bacterias que podrían ser importantes en las respuestas al estrés causado por metales

This thesis has been funded by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness through the STREAMFISH Project (CGL2013-43822-R) and the STRESSFISH Project (CGL2016-80820-R). This research work was also funded by the program of grants for the improvement of the scientific productivity of the research groups of the University of Girona 2016-2018 (MPCUdG2016/120) with the Project: “Fluvial microbial microfilms under conditions of stress”. María Argudo Fernández was supported by FI-DGR pre-doctoral scholarship 2016 FI-B 00284 from the Agency for Management of University and Research Grants (AGAUR) of Government of Catalonia

Programa de Doctorat en Ciència i Tecnologia de l’Aigua

Universitat de Girona