Ítem
Ribó i Panosa, Marc
Ribó i Panosa, Marc |
|
Universitat de Girona. Departament de Biologia | |
Gordo Hernández, Verónica | |
23 juny 2021 | |
Protein splicing is an autocatalytic process with different stages that involves the elimination of
an internal sequence, called intein, from the precursor polypeptide chain and the formation of
a peptide bond between the flanking regions called N and C exteins. The split inteins or trans -
inteins are a type of inteins that are encoded in two different genes together with the N extein
and C extein genes.
The DNA polymerase B gene of the hyperthermophilic archaebacterium Nanoarcheaum
equitans is divided into two open reading frames. The genes coding for the N-terminal and Cterminal
region or domains of the polymerase (N and C exteins) are fused respectively with the
genes coding for N intein and C intein of the starting split intein Neq pol.
The present thesis studies, the trans-splicing reaction catalyzed by the split intein Neq pol, as
well as characterizes the physicochemical properties of the N-terminal fragment, NeqN, and the
NeqN/ NeqC complex. On the other hand, the association process between the two fragments
is also studied from a kinetic and thermodynamic point of view. L’splicing de proteïnes és un procés autocatalític composat per diferents etapes que implica l’eliminació d’una seqüència interna, anomenada inteïna, de la cadena polipeptídica precursora i la formació d’un enllaç peptídic entre les regions flanquejants, anomenades exteïnes N i C. Les inteïnes partides o trans-inteïnes són un tipus d’inteïnes que estan codificades en dos gens diferents juntament amb els gens de l’exteïna N i l’exteïna C. El gen de la DNA polimerasa B de l’arqueobacteri hipertermòfil Nanoarchaeum equitans està dividit en dos marcs oberts de lectura. Els gens que codifiquen per les regions o dominis Nterminal i C-terminal de la polimerasa (exteïnes N i C) estan fusionats, respectivament, als gens que codifiquen per la inteïna N i la inteïna C de la inteïna partida Neq pol. En la present tesi s’estudia la reacció de trans-splicing catalitzada per la inteïna partida Neq pol, així com es caracteritzen les propietats fisicoquímiques del fragment N-terminal, NeqN, i del complex NeqN/NeqC. D’altra banda, també s’estudia des d’un punt de vista cinètic i termodinàmic el procés d’associació entre els dos fragments de la inteïna. Programa de Doctorat en Química |
|
http://hdl.handle.net/10803/687807 | |
http://hdl.handle.net/10256/22824 | |
cat | |
Universitat de Girona | |
ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L’accés als continguts d’aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d’investigació i docència en els termes establerts a l’art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l’autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s’autoritza la seva reproducció o altres formes d’explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d’un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s’autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs. | |
Polimerasa B
Polymerase B Inteïna Intein Enginyeria de proteïnes Protein engineering Ingeniería de proteínas Inteina Nanoarchaeum equitans 575 577 |
|
Estudi de la reacció de trans-splicing i caracterització fisicoquímica de la inteïna partida Neq DNA polimerasa B de l’hipertermòfil N. equitans | |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | |
DUGiDocs |